《南京临时政府遗存珍档》是中国第二历史档案馆在整理馆藏北洋政府档案时新发现的一批珍贵的档案文献，总计数量约700余件。这批新发现的南京临时政府档案，其内容分为三大部分:一是大总统府文档，包括临时大总统令、批等档案原件，
《南京临时政府遗存珍档》是中国第二历史档案馆在整理馆藏北洋政府档案时新发现的一批珍贵的档案文献，总计数量约700余件。这批新发现的南京临时政府档案，其内容分为三大部分:
一是大总统府文档，包括临时大总统令、批等档案原件，均由孙中山先生亲笔签发，这是有关孙中山先生存世档案与文物的一次重大发现。
二是总统府电报房来电，从1911年12月14日起，止于1912年4月7日。这批收文电报编号从第1号至第554号，比较完整系统地记录了孙中山先生1912年元且在南京宣誓就任临时大总统起至1912年4月1日宣布解职为止，其所与闻及处理的政治、外交.军事、内政、经济等各方面的大事，这是有关孙中山大总统府重要文档的极具价值的发现与补充。
三是南京临时政府外交部文档，记录了南京临时政府在短短三个月的执政时间内，在外交方面做出的巨大努力和取得的成就。其中包括处理印尼华侨受迫害事件，保护海外华人华侨权益;办理上海、厦门等地外国租界会审公堂及设立华洋裁判所等事关国家主权的外交事件;办理与收解海关事权及税收、推行禁烟禁毒事务及与英、法、德、俄等国的交涉等多项外交活动。这批内容丰富的外交档案，既可以使我们重新认识并了解孙中山先生肇建共和之初的外交斗争，也使有关南京临时政府珍贵档案的国家典藏得到了进一步的补充与丰富。
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